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生物信息学入门课:最常用的生信N张图

2023-03-13 16:10课程 人已围观

个人简介
大家好,我是孟浩巍。很高兴能够在腾讯课堂与大家见面!


我目前就读与北京大学生命科学学院,正在攻读博士学位,在5年学习生物信息学分析的过程中积累了大量经验,很愿意分享给大家。
之前在某乎平台,我创建了一系列在线课程,先后有数万人参与并获得全部好评。

此外,我还创建了名为【生信坑】(可通过搜索引擎搜索)的生物信息学问答网站,欢迎大家有问题到网站上进行交流!

课程介绍
生物信息学是一门非常交叉的学科,统计学,计算机科学,机器学习,前端可视化甚至是软件工程都能在生物信息学这个交叉学科中找到用武之地。本次课程是生物信息学入门系列课程的一部分,在本次课程中将会着重与大家探讨与生物信息学中数据可视化相关的问题。

在学习和入门生物信息学的过程中,我们经常会有这样的两个困惑:一是在读论文或者听报告的时候看不懂一些生物信息学常用图表;二是手里拿到了实验数据,分析结果苦于不知道用什么样的图表去展示和突出。

其实这两个问题本质上都可以总结为数据可视化的问题,而数据可视化是一个非常大的题目,我们本次课程主要是为大家介绍生物信息学中一些常见的图表,比如heatmatp(热图),MAplot,volcano plot(火山图), 功能富集分析图(GO富集分析图),GSEA分析图等等。除此以外,我们还会为大家奉上相对应的R语言实现方法,帮助大家能够直接将视频内容应用到课题或者项目当中。

希望大家多多支持!

课程重要目录
  • 差异表达基因的heat map;
  • 展示基因分布特点的MA plot;
  • 突出筛选条件的volcano plot;
  • 功能富集分析最常用的figures(以GO分析为例);
  • GSEA的图表详解;
  • 探索整体分布的累积分布曲线;
  • 上述图表的R语言实现
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