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TCGA数据库批量挖掘lncRNA(批量生存曲线/长非编码RNA/COX模型

2023-12-04 21:57课程 人已围观

适用人群
生物信息学学员,高校生物、计算机相关专业教师、学生,医学科研人员,医院从业人员,生物专业相关从业人员
课程概述
TCGA数据库批量lncRNA课程简介,网页下载数据,命令行下载数据,数据合并成矩阵,id转换和添加基因属性,lncRNA差异表达,lncRNA热图绘制,提取生存时间,lncRNA表达量和生存时间合并,批量生存分析,单因素cox分析,提取单因素显著的lncRNA,多因素模型构建,风险生存曲线,ROC曲线和AUC值,C-index值计算,风险热图绘制,风险曲线绘制,生存状态图,共表达预测lncRNA靶基因,基因名字转换为id,GO功能富集分析,KEGG通路富集分析。
本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。

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